Niet alleen de omvang van natuur, ook de kwaliteit ervan is belangrijk. Uit de voortgangsrapportage blijkt dat de natuurkwaliteit op het niveau van de doelen van de Vogel- en Habitatrichtlijn onvoldoende blijft. Ongeveer driekwart van de Habitatrichtlijnsoorten en 90% van de habitattypen verkeren over de periode 2013-2018 in een ongunstige staat van instandhouding. Kijken we naar de toestand en trend van alle soorten en ecosystemen in Nederland, dan zijn deze stabiel of is er sprake van een lichte afname.
In 2020 heeft het kabinet besloten om tot en met 2030 € 3 miljard te investeren via het Programma Natuur in extra natuurherstel en -ontwikkeling, vooral in en rondom stikstofgevoelige Natura 2000-gebieden. In 2021 hebben provincies het Provinciaal Uitvoeringsprogramma opgesteld en de voorbereiding van de diverse projecten voor natuurherstel gestart.
In het coalitieakkoord is ook het Nationaal Programma Landelijk Gebied aangekondigd waarin de opgaven op het gebied van natuur, stikstof, water en klimaat in samenhang worden aangepakt. De afronding van het Natuurnetwerk Nederland maakt hiervan onderdeel uit.